为进一步完善生态功能监测基础设施，补充保护区水文数据这一空白，管护中心积极争取项目资金，坚持“尊重自然、顺应自然、保护自然”的生态文明理念，遵循实用可靠、技术先进、经济合理、统筹兼顾的原则，经省林草局批准建成水文监测站。

保护区水文监测系统由自动雨量监测设施、水位站设施、水文站设施、水文观测站房、数据采集终端机配套设施和终端平台设施等组成，具备实时感知、多维监测、智能物联、精准管控等能力，主要对保护区磨沟河水质、地表径流量、林区降雨量、蒸发量和环境因子等进行监测，并通过数据采集终端进行实时传输，真正实现了水质、径流量、环境等相关因子的数字化呈现，并布设监控对周围环境进行实时巡查监测。

水文监测站的建成，可及时掌握保护区水文数据，为保护区水资源变化、分析评价保护区森林水源涵养能力和生态保护效益能力提供科学依据，为当地水资源管理、生态保护和防洪减灾提供数据支撑。