近年来，九连山保护区坚持“保护立区、人才强区、科研兴区、文化靓区”的建设思路。以江西九连山森林生态系统国家定位观测研究站建设为依托，不断加大科研投入力度，大力发展科研兴区战略，并努力创新科研工作方式，推进科研监测成果化，打造保护区科研工作新面貌，科研成效显著。

一是成功申报了江西九连山森林生态系统国家定位观测研究站建设项目，生态定位研究站的基础建设、仪器设备全部安装到位并投入运行，新建了生态定位观测云平台系统；七月中旬国家林业和草原局生态系统定位观测研究站评估专家组到生态定位研究站开展现场评估，同时对生态站建设及运行管理工作给予了充分肯定和高度评价；二是启动了南岭山地昆虫调查，先后有四批八十多人次共同参与昆虫调查；三是加强与中山大学合作，启动了开展九连山保护区综合科学考察工作；四是与江西农业大学签订了《深化合作协议》，在充分利用生态定位研究站平台的基础上，开展广泛深入的交流与合作；五是通过与赣南医学院合作，新建了九连山保护区中草药标本馆。

近年来，九连山保护区先后发现了九连山角蟾、东方短腿蟾、布窗斑弄蝶离斑亚种、九连山小蠹、毕氏异胫长小蠹、九连山铁角蕨、华南二叉韧革菌和厚囊原毛平革菌共八个新物种；发现动植物江西分布新纪录32种，九连山新纪录117种；发表论文23篇，其中SCI 4篇，核心期刊7篇；南岭山地昆虫调查全面进行，与中山大学联合进行第二期综合科考，与江西农大合作进行生态价值评估，九连山生态定位站云平台正式开通；出版了《九连山鸟类图谱》、《九连山森林生态研究》、《江西九连山气象水文研究报告》、《九连山蕨类植物》、《九连山蛇类图鉴》、《生态研究昆虫动物专辑》等13部专著；科研工作被列为长江经济带国家级自然保护区管理评估十佳案例，由中国环境出版集团《中观经济》出版，在昆明举办的全球生物多样性大会上展示推介。